Los investigadores del CEstA están vinculados a los siguientes grupos de investigación del CNPQ:
- Algoritmos, complejidad y optimización combinatoria
- Arqueología Guaraní: territorialidad y cultura material - UFRGS
- Arqueología Pública
- Centro de Estudios Mesoamericanos y Andinos - CEMA/USP
- Estudio de las Tierras Arqueológicas Negras (Antropogénicas) en la Amazonía
- Grupo de Antropología Visual - USP (LISA)
- Imágenes, Narrativas y Prácticas Culturales - INARRA/UERJ
- Inteligencia y Conocimiento: Memoria, Tecnología y Organización de la Información
- Laboratorio de Antropología Simétrica - UERJ
- Núcleo de Antropología Urbana - NAU/USP
- Núcleo de Estudios e Investigación de Narrativa-Nucen - UNEAL
- Núcleo de Historia Indígena e Indigenismo - NHII/USP
- Paisaje y paleo-nobotánica en la prehistoria de Brasil
- Técnicas analíticas nucleares aplicadas a los estudios ambientales y arqueológicos